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274. Montagsgespräch

protein shapes

Jutta Köhler
Jörg Schäffer

Montag 14. Juni 2010 20 Uhr / Eintritt frei
Carl Orff Auditorium München
Luisenstr. 37a, U-Bahn Königsplatz

Bilder 

Proteine bestehen aus Aminosäuren, die wie Perlen auf einer Kette aneinander gereiht sind. Diese „Ketten“ falten sich zu einer dreidimensionalen Struktur, deren Form von der Reihenfolge der Aminosäurenbausteine abhängt. Große Proteine bestehen aus mehreren Domänen. Es gibt zwei kompakte Strukturelemente, die „alpha-helices“ und die „beta-sheets“, die durch sogenannte „loops“ untereinander verbunden sind. Alpha-helices sind zylinderförmig während die beta-sheets Flächen darstellen. Die loops haben meist eine Länge von bis zu zehn Aminosäuren. Es gibt aber auch sogenannte long loops, die entferntere Domänen verbinden. Dies scheint eine Bedeutung bei der Proteinfaltung zu haben, die meist über mehrere Zwischenstufen verläuft. Die Faltung der Proteine hat in den letzten 20 Jahren ein besonders starkes Interesse sowohl bei experimentellen Arbeitsgruppen als auch in der theoretischen Chemie gefunden. Die allgemeine ab initio Vorhersage einer 3D Struktur aus einer Aminosäuresequenz ist bis heute für Proteine ungeklärt. Es ist aber bereits möglich, für kleine Proteine, d.h. für Peptide, deren wahrscheinliche räumliche Struktur zu modellieren.

www.wave-art.de

Wir möchten einige 3D Strukturen von Proteinen als Videoprojektion zeigen und dazu eine Vertonung der charakteristischen Strukturelemente (helices, sheets, loops) vornehmen, die in diesem Montagsgespräch life (ein bis drei Musiker) aufgeführt werden soll.

Die Titel:

1.) 1TIZ - EFhand 2'50"
2.) 1JXC - a trypsin/chymotrypsin inhibitor 3'
3.) 1Q4R - function unknown 4'50"
4.) 1VK0 - exonuclease 8'50"
5.) 1RJJ - monooxygenase 9'30"
6.) 1VJI - oxophytodienoate reductase isoform 1 16' 

Letzte Änderung: 17.12.2010
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